Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LPIN3Q9BQK8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms