Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOPXQ9BPY8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOPXQ9BPY8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms