Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3R4Q99570 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms