Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRBNQ96SW2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRBNQ96SW2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms