Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSNARE1Q96NA8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms