Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNBD2Q96M20 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms