Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC136Q96JN2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC136Q96JN2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms