Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPDL1Q96EA4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms