Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms