Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC9A6Q92581 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A6Q92581 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms