Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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UBXN4Q92575 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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