Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms