Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC4Q8WW27 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms