Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A9Q8NBW4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms