Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZIC4Q8N9L1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms