Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00612Q8N6U2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms