Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms