Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC82Q8N4S0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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