Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms