Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC117Q8IWD4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms