Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HECW1Q76N89 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HECW1Q76N89 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms