Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH2Q76I76 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH2Q76I76 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms