Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEM1Q6ZVN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms