Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00299Q6ZSB3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms