Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL4Q6XD76 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASCL4Q6XD76 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms