Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINGO4Q6UY18 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms