Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms