Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL17Q6UXB2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL17Q6UXB2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms