Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBR1LQ6UX01 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBR1LQ6UX01 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms