Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C16orf54Q6UWD8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms