Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL35Q6PF15 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms