Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDE2Q6IQ49 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms