Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1QL3Q5VWW1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1QL3Q5VWW1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms