Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q56UQ5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q56UQ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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