Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PKDCCQ504Y2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKDCCQ504Y2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms