Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC38Q502W7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms