Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYTL3Q4VX76 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms