Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TBRG1Q3YBR2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms