Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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