Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
EDRF1Q3B7T1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EDRF1Q3B7T1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms