Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TWISTNBQ3B726 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms