Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL40Q2TBA0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms