Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MICAQ29983 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAQ29983 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms