Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FSCN1Q16658 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms