Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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