Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPE65Q16518 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms