Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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