Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZFHX3Q15911 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZFHX3Q15911 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ZFHX3Q15911 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ZFHX3Q15911 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZFHX3Q15911 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ZFHX3Q15911 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZFHX3Q15911 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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ZFHX3Q15911 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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