Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRK1Q15835 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRK1Q15835 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms