Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA2Q15822 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms